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      為什么這個(gè)線性混合模型是奇異的?

      2021-02-18 21:52

      我試圖理解為什么在對(duì)下面的數(shù)據(jù)擬合線性混合效應(yīng)模型時(shí)會(huì)得到奇異擬合。I使用R lme4::lmer,模型非常簡(jiǎn)單,只有截距作為固定效應(yīng),因子變量作為隨機(jī)變量。以下

      解答動(dòng)態(tài)

        • id))邊界(單數(shù))擬合:參見?Isangularlt;lt;<;總結(jié)(擬合)線性混合模型REML擬合['lmerMod']公式:y~1+(1

          • 組id)數(shù)據(jù):收斂時(shí)的dataREML標(biāo)準(zhǔn):239標(biāo)度殘差:最小1Q中位數(shù)3Q最大-2.139-0.604-0.093 0.467 3.242隨機(jī)效應(yīng):組名方差標(biāo)準(zhǔn)偏差.組id(截距)0.00 0.00殘差7.05 2.66obs數(shù)量:50,組:組id,5固定效應(yīng):估計(jì)標(biāo)準(zhǔn)誤差t值(截距)8.641 0.376 23優(yōu)化器(nloptwrap)收斂代碼:0(確定)邊界(奇異)擬合:參見?issingular 對(duì)于isSingular的幫助是,方差協(xié)方差矩陣的一些“維度”被精確地估計(jì)為零,我想從數(shù)據(jù)中了解發(fā)生這種情況的原因。

            • 正如您所發(fā)現(xiàn)的,當(dāng)其中一個(gè)方差分量被估計(jì)為零時(shí),就會(huì)發(fā)生這種情況。這通常有兩個(gè)exp之一語(yǔ)言:
              隨機(jī)效應(yīng)結(jié)構(gòu)是過度擬合的-通常是因?yàn)樘嗟碾S機(jī)斜率,一個(gè)更大的方差分量實(shí)際上非常接近于零,并且沒有足夠的數(shù)據(jù)估計(jì)它高于零。顯然第一種情況不是你的數(shù)據(jù),因?yàn)槟阒挥须S機(jī)變量
              所以組id的隨機(jī)截獲的實(shí)際變化很可能接近于零。如果是,那么只有5組,軟件可能無法估計(jì)大于零的方差資料圖:我們可以我們已經(jīng)看到,與組內(nèi)的變化相比,組平均值的變化很??br/> 我們可以從三個(gè)方面(至少)更正式地研究這個(gè)問題:
              首先,讓我們來看看每一種方法的數(shù)據(jù)組別:
              庫(kù)(tidyverse)數(shù)據(jù)%gt;%匯總(平均值=平均值(y))##1 8.85##2 9.65##3 8.84##4 7.70##5 8.17 請(qǐng)注意,所有組之間的差異非常小,但請(qǐng)注意,組1和組3的平均值幾乎相同。讓我們把第1組去掉,看看是什么發(fā)生:
              data%gt;%lmer(y~1+(1

              • 組id),data=)%lt;-100simvec_rintlt;-數(shù)值(n.sim)#向量,用于保存(i in 1:n.sim){播種(i) data$y1=data$y+rep(rnorm(5,0,1),每個(gè)=10)m0<;-lmer(y1~1+(1

                • 組id),data=data)if(!isSingular(m0)){#如果模型不是奇異的,則提取隨機(jī)和固定效應(yīng)VarCorr(m0)%gt;%拉(vcov)%gt;simvec\u rint[i]摘要(m0)%gt;%作為向量()%gt;simvec\u fint[i]}其他{simvec\u rint[i]lt;-所以我們?cè)诜讲顬?的群中加入了隨機(jī)噪聲。蒙特卡羅估計(jì)是:
                  gt;平均值(simvec\u fint,不適用rm=TRUE)[1]8.637063 注即:
                  方差其中隨機(jī)截獲數(shù)為1.12。然而,我們把方差加到了等于1的組中,這意味著原始數(shù)據(jù)中隨機(jī)截距的方差接近于零,正如我們所懷疑的那樣。
                  固定截距是8.64,這與原始數(shù)據(jù)擬合的模型基本相同。
                  最后,讓我們看一個(gè)沒有隨機(jī)效應(yīng)的模型,很明顯這將是一個(gè)方差分析:
                  gt;%summary()Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(gt;lm(y~組id,data=data)%gt;

                  • t

                    • )(截距)8.8510 0.8479 10.438 1.33e-13***組

                      • id2 0.7950 1.1992 0.663 0.511組

                        • id3-0.0150 1.1992-0.013 0.990組

                          • id4-1.1490 1.1992-0.958 0.343組

                            • id5-0.6810 1.1992-0.568 0.573 因此也很少有證據(jù)表明組2、3、4和5具有不同的第1組的平均值。這兩種模型都與混合模型中隨機(jī)截距的變化很小的情況相一致。因此,總而言之,在這種情況下,我們可以得出結(jié)論,由于組數(shù)較少,組間估計(jì)的變化較小,軟件無法估計(jì)零以上的隨機(jī)截距變化,因此模型是奇異的,盡管模型估計(jì)似乎是可靠的

                              • End

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