"\u003Cp\u003E半島記者 韓小偉\u003C\u002Fp\u003E\u003Cp\u003E7月20日半島記者獲悉，黃海水產(chǎn)研究所完成國(guó)際首個(gè)蚶科基因組參考圖譜。在不久之前，黃海水產(chǎn)研究所等單位聯(lián)合完成鞍帶石斑魚基因組精細(xì)圖譜繪制。據(jù)悉，近年來青島在水產(chǎn)養(yǎng)殖領(lǐng)域的基因研究走在了全國(guó)前列，除了鞍帶石斑魚，先后完成了牡蠣、半滑舌鰨、褐牙鲆、扇貝、花鱸五大養(yǎng)殖海鮮的基因圖譜繪制。\u003C\u002Fp\u003E\u003Cimg src=\"http:\u002F\u002Fp1.pstatp.com\u002Flarge\u002Fpgc-image\u002FRWlMu5IGlTfBwz\" img_width=\"554\" img_height=\"257\" alt=\"剛“解鎖”石斑魚基因精細(xì)圖譜，島城科學(xué)家又破譯大毛蛤“基因天書”\" inline=\"0\"\u003E\u003Cp\u003E\u003Cstrong\u003E產(chǎn)業(yè)擴(kuò)大但質(zhì)量下降 破譯基因組意義重大\u003C\u002Fstrong\u003E\u003C\u002Fp\u003E\u003Cp\u003E日前，在國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃和貝類產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系等項(xiàng)目支持下，黃海水產(chǎn)研究所王崇明研究員團(tuán)隊(duì)、楊愛國(guó)研究員團(tuán)隊(duì)與德國(guó)阿爾弗雷德·韋格納研究所赫爾姆霍茲極地和海洋研究中心Umberto Rosani博士等合作，成功破譯魁蚶基因組，研究成果于7月9日正式發(fā)表在GigaScience雜志。\u003C\u002Fp\u003E\u003Cp\u003E該研究利用第二、三代測(cè)序和Hi-C染色體構(gòu)象捕獲技術(shù)，構(gòu)建了國(guó)際上首個(gè)染色體水平的蚶科動(dòng)物基因組參考圖譜。研究揭示魁蚶基因組大小為885 Mb，Scaffold N50達(dá)到45 Mb，利用Hi-C技術(shù)成功將99.35%的組裝序列掛載到染色體上，經(jīng)進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)魁蚶基因組中重復(fù)序列高達(dá)408 Mb，占基因組總長(zhǎng)的46%。\u003C\u002Fp\u003E\u003Cp\u003E魁蚶俗稱赤貝、血貝、大毛蛤，是一種大型海洋底棲經(jīng)濟(jì)貝類，廣泛分布于太平洋西北部的日本海、黃海、渤海及東海沿岸，成貝個(gè)大體肥，肉質(zhì)鮮美，經(jīng)濟(jì)價(jià)值較高。近年來，我國(guó)魁蚶苗種生產(chǎn)和增養(yǎng)殖規(guī)模不斷擴(kuò)大，經(jīng)濟(jì)和社會(huì)效益顯著，然而其種質(zhì)質(zhì)量下降、病害高發(fā)等問題日趨嚴(yán)重�？�蚶及蚶科貝類基因組信息的匱乏成為我們理解其抗病、抗逆機(jī)制的障礙，破譯魁蚶基因組信息、開展重要性狀遺傳改良成為當(dāng)下的重要課題。該項(xiàng)研究成果為蚶科貝類抗病抗逆、生長(zhǎng)發(fā)育等重要性狀的遺傳解析以及種質(zhì)改良等相關(guān)研究提供了重要理論支撐。\u003C\u002Fp\u003E\u003Cp\u003E\u003Cstrong\u003E“解鎖”體型最大石斑魚基因精細(xì)圖譜\u003C\u002Fstrong\u003E\u003C\u002Fp\u003E\u003Cp\u003E本月初消息，黃海水產(chǎn)研究所等單位聯(lián)合完成鞍帶石斑魚基因組精細(xì)圖譜繪制。\u003C\u002Fp\u003E\u003Cp\u003E石斑魚是廣泛分布于印度洋-太平洋熱帶和亞熱帶海域的巖礁魚類，也是我國(guó)重要的海水養(yǎng)殖經(jīng)濟(jì)魚類。鞍帶石斑魚，俗名龍膽石斑、龍躉，是石斑魚類中體型最大、生長(zhǎng)最快的一種石斑魚，具有抗病力強(qiáng)、生長(zhǎng)快速、味道鮮美等特點(diǎn)，因而廣泛應(yīng)用于石斑魚雜交育種和良種選育。作為體型最大的肉食性巖礁魚類，鞍帶石斑魚對(duì)于巖礁生態(tài)系統(tǒng)亦具有重要影響。\u003C\u002Fp\u003E\u003Cp\u003E日前，在山東省農(nóng)業(yè)良種工程等項(xiàng)目支持下，黃海水產(chǎn)研究所陳松林研究員團(tuán)隊(duì)、中山大學(xué)林浩然院士團(tuán)隊(duì)和美國(guó)密歇根州立大學(xué)李偉明教授團(tuán)隊(duì)等，聯(lián)合完成了鞍帶石斑魚（龍膽石斑）的全基因組測(cè)序和基因組圖譜繪制，并解析了其先天性免疫和快速生長(zhǎng)的基因組學(xué)機(jī)制。據(jù)悉，該研究成果于6月22日在國(guó)際重要學(xué)術(shù)刊物《分子生態(tài)資源》（Molecular Ecology Resources）上在線發(fā)表。\u003C\u002Fp\u003E\u003Cp\u003E據(jù)介紹，鞍帶石斑魚基因組精細(xì)圖譜的完成，為解析石斑魚科魚類生長(zhǎng)、抗病等重要經(jīng)濟(jì)性狀的分子機(jī)制奠定了重要基礎(chǔ)；同時(shí)，鞍帶石斑魚全基因組數(shù)據(jù)也為石斑魚雜交育種及良種選育技術(shù)的發(fā)展提供了有價(jià)值的基因資源，對(duì)于推動(dòng)石斑魚產(chǎn)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展具有重要意義。\u003C\u002Fp\u003E\u003Cp\u003E\u003Cstrong\u003E五大養(yǎng)殖海鮮基因已有精細(xì)圖譜\u003C\u002Fstrong\u003E\u003C\u002Fp\u003E\u003Cp\u003E據(jù)了解，基因研究成為近年來生物學(xué)、醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)，近年來青島在水產(chǎn)養(yǎng)殖領(lǐng)域的基因研究走在了全國(guó)前列。\u003C\u002Fp\u003E\u003Cp\u003E2018年底，在青島海洋科學(xué)與技術(shù)試點(diǎn)國(guó)家實(shí)驗(yàn)室科技創(chuàng)新計(jì)劃和鰲山人才培養(yǎng)計(jì)劃項(xiàng)目的支持下，黃海水產(chǎn)研究所陳松林研究員領(lǐng)銜并聯(lián)合青島華大基因研究院歷經(jīng)3年努力，首次完成了花鱸全基因組測(cè)序和精細(xì)圖譜繪制�；�鱸全基因組的解譯對(duì)于花鱸生命特征的深入認(rèn)知以及花鱸分子遺傳育種的研究具有重要意義，為建立花鱸基因組選擇育種技術(shù)、培育高產(chǎn)抗病優(yōu)質(zhì)良種提供了基因資源和技術(shù)手段。\u003C\u002Fp\u003E\u003Cp\u003E花鱸俗稱鱸魚、七星鱸、花寨，廣泛分布于渤海至南海的近岸水域以及通海的江河水域，是一種廣溫廣鹽性兇猛肉食性經(jīng)濟(jì)魚類，具有生長(zhǎng)較快、適應(yīng)性廣、味道鮮美等特點(diǎn)�；�鱸既是我國(guó)重要海水養(yǎng)殖魚類，也可以作為淡水馴化養(yǎng)殖的重要魚類。2016年我國(guó)花鱸的養(yǎng)殖產(chǎn)量為13萬(wàn)噸左右。\u003C\u002Fp\u003E\u003Cp\u003E此外，2010年，位于青島的中科院海洋研究所完成了牡蠣基因組序列圖譜繪制，這是世界上第一張養(yǎng)殖貝類的全基因組序列圖譜；同年，黃海水產(chǎn)研究所完成了半滑舌鰨全基因組測(cè)序和組裝，繪制出半滑舌鰨全基因組序列圖譜，是我國(guó)完成的第一個(gè)魚類基因組測(cè)序項(xiàng)目和全基因組序列圖譜；2016年，由黃海水產(chǎn)研究所陳松林研究員帶領(lǐng)的研究組聯(lián)合科研人員破譯了褐牙鲆全基因組序列；2017年，中國(guó)海洋大學(xué)科研人員領(lǐng)銜的國(guó)際科研團(tuán)隊(duì)在國(guó)際上首次完成了扇貝基因組精細(xì)圖譜繪制，為理解動(dòng)物早期起源和演化機(jī)制提供關(guān)鍵線索。\u003C\u002Fp\u003E"

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