本區(qū)缺失下泥盆其他晚古生代分泛，地層連化石豐富，是研究晚古生代地層的重要地區(qū)之一。
1.布拉克巴什組（D2b）
出露于木孜塔格地區(qū)的兔子湖-寒凝泉一帶，主要為碳酸鹽巖和火山碎屑巖，其間夾少量碎屑巖，屬于淺海碳酸鹽臺(tái)地相沉積，其中火山巖是在大陸邊緣碳酸鹽臺(tái)地上發(fā)育的海相火山巖，以爆發(fā)相為主，噴溢相次之。具體見昆中北地層區(qū)。
2.上泥盆統(tǒng)D3（未分）
零星出露于祁漫塔格山西部的奧依亞依拉克地區(qū)刀鋒山附近，為深海盆地斜坡相陸源碎屑巖沉積。下部為深灰色厚層硅質(zhì)巖夾中厚層含礫細(xì)-粗砂巖、粉砂巖及薄層泥灰?guī)r等；上部為灰、深灰色塊狀角礫狀灰?guī)r、礫屑灰?guī)r夾黑灰色薄層泥灰?guī)r、頁(yè)巖及中厚層石英砂巖、硅質(zhì)巖等。呈構(gòu)造巖片產(chǎn)出，底為斷層，地層出露不全，難以建組，厚度不詳。
含牙形刺 Palmatolepis minuta minut，P.glabra pectinata，Protograthodus kockeli，P.cordiformis，Polygnathus sp.；珊瑚Temnophyllum sp.；層孔蟲Amphipora sp.；腕足類殘片等。其中牙形刺Palmatolepis minuta minut，P.glabra pectinata 見于貴州長(zhǎng)順、惠水、紫云等地的五指山組，是貴州牙形刺帶Palmatolepis minuta minut-Palmatolepis rugosa rugosa中的重要分子，屬晚泥盆世錫礦山期；Protograthodus kockeli，Polygnathus sp.，見于貴州長(zhǎng)順睦化地區(qū)五指山組頂部，是該區(qū)牙形刺帶Sphonodella praesulcata-Spiphomodella-sul-cata 中的常見分子，屬晚泥盆世晚期-早石炭世早期。珊瑚Temnophyllum sp.為中晚泥盆世。層孔蟲Amphipora sp.時(shí)限較長(zhǎng)，泥盆-二疊紀(jì)均可見及。根據(jù)上述化石，該地層單元屬晚泥盆世晚期。
青海格爾木之南水泥廠地區(qū)小水泉以南及南溝中游兩側(cè)出露有片理化變形礫巖、片理化變砂巖夾千枚巖及粉砂質(zhì)板巖，與下伏地層呈斷層接觸，視厚度為906 m。該套粗碎屑巖是塊體狀山嶺隆起剝蝕期暫時(shí)水流和經(jīng)常洗刷活動(dòng)的結(jié)果。該套地層未找到化石，其時(shí)代難以肯定，根據(jù)巖石組合特征，與祁漫塔格地區(qū)晚泥盆世黑山溝組比較接近，因此暫將其置于晚泥盆世，歸未分的上泥盆統(tǒng)。
3.托庫(kù)孜達(dá)坂組（C1t）
昆中北和昆南地層區(qū)均有出露，具體見昆中北地層區(qū)。
4.哈拉郭勒組（C1hl）
出露于東昆侖阿拉克湖幅的哈拉郭勒、捎斯攔趕隴郭勒一帶，在希里可特-草木策一帶呈小而狹長(zhǎng)的斷塊出露，沿馬爾爭(zhēng)山腳下零星出露。為海陸交互相碎屑巖、碳酸鹽巖及含煤地層。主要巖性下部為石英砂巖、粉砂巖、板巖夾含礫石英砂巖、灰?guī)r；中部為灰黑色生物碎屑巖夾黑色頁(yè)巖、煤線及少量凝灰?guī)r、板巖夾生物碎屑灰?guī)r。產(chǎn)珊瑚、腕足類和雙殼類等化石，為三角洲相及內(nèi)陸棚相沉積。
產(chǎn)四射珊瑚Palaeosmilia sp.，P.fraternal，Dibunophyllum sp.，D.rhodophylloides，Het-erocaninia intermedia，Lophophyllum sp.，Kueizhouphyllum sp.，Neokoninckophyllum sp.；床板珊瑚Aulina（Pseudoaulina）carinata；腕足類Gigantoproductus moderatus，Echinoconchus minatus，Linoproductus elongata；雙 殼 類 Palaeolima sp.等。其 中 Dibunophyllum，kueizhouphyllum，Heterocaninia intermedia，Linoproductus，Echinoconchus 等都是我國(guó)南方早石炭世晚期常見的標(biāo)準(zhǔn)化石。哈拉郭勒組的時(shí)代為早石炭世晚期，即維憲期。
哈拉郭勒組與托庫(kù)孜達(dá)坂組為同時(shí)異相沉積，前者為海陸交互相，后者為次深海-深海相，說明早石炭世時(shí)沿馬爾爭(zhēng)-布青山構(gòu)造帶的環(huán)境仍比較穩(wěn)定。
5.哈拉米蘭河群（C1-2H）
昆中北和昆南地層區(qū)均有出露，具體見昆中北地層區(qū)。
6.浩特洛哇組（C2-P1h）
昆中北和昆南地層區(qū)均有出露，在昆南區(qū)向南火山巖增多，水體加深，具體見昆北地層區(qū)。
7.樹維門科組（P1-2sh）
出露于奧依亞依拉克地區(qū)的牙甫克里克，銀石山地區(qū)的懷玉崗、五泉包，木孜塔格地區(qū)的黑頂山北，鯨魚湖地區(qū)的龍泉驛南、野狼山、葫蘆嶺一帶，布喀達(dá)坂峰地區(qū)的哈夏·克里克·得亞等地，阿拉克湖地區(qū)的哥瓊尼洼、約古宗列北側(cè)等地。為碎屑巖、碳酸鹽巖夾火山巖。有鈣質(zhì)礫巖、含礫粗砂巖、巖屑石英砂巖、鈣質(zhì)板巖、泥灰?guī)r、瘤狀灰?guī)r、泥晶灰?guī)r、生物碎屑灰?guī)r、白云質(zhì)粉晶灰?guī)r、白云質(zhì)灰?guī)r、硅化火山灰凝灰?guī)r夾黑綠色蛇紋巖等。與下伏地層多數(shù)為斷層接觸，未見底，厚度大于4436 m。為濱淺海相至碳酸鹽臺(tái)地相。
在阿拉克湖及冬給措納湖地區(qū)為生物礁建造。呈一系列推覆體出露于昆南斷裂帶，下部為深灰色中厚層狀生物碎屑灰?guī)r、砂屑灰?guī)r、礁碎塊礫屑灰?guī)r、鈣質(zhì)砂巖、變雜砂巖、變粉砂巖及粉砂質(zhì)板巖互層；上部生物礁灰?guī)r，可細(xì)分出生物骨架灰?guī)r、粘結(jié)灰?guī)r、礁屑粒泥灰?guī)r、礁碎塊礫屑灰?guī)r和生屑亮晶灰?guī)r。
造礁生物有Archaeolithoporella（古石孔藻）、Tubiphytes carnthiatus，T.obscure，Tabulo-zoa；四射珊瑚Liangshsnophyllum sp.等。附礁生物非常豐富，有
Schwagrina sp.，Para-fusulina sp.，Neoschwagerina sp.；有孔蟲：Pachyphloia sp.；腕足類 Martinia sp.，Pseud-oavonia lopingensiformis，Dictyoclustus sp.，D.rithofeni；單體四射珊瑚 Iranophyllum xing-haiensis，以及少量鸚鵡螺類和大量海百合莖碎片。 據(jù)上述化石，尤其是
和四射珊瑚等確定樹維門科組的時(shí)代為早、中二疊世，以中二疊世為主。 據(jù)造礁、附礁生物及巖性特點(diǎn)，沉積環(huán)境有礁核相、礁前斜坡相、礁后潟湖相、開闊海碳酸鹽臺(tái)地相。
東昆侖-阿尼瑪卿地區(qū)二疊紀(jì)時(shí)與揚(yáng)子地區(qū)同屬古特提斯海區(qū)，該區(qū)發(fā)現(xiàn)生物礁尚屬首次，給我國(guó)二疊紀(jì)生物礁的研究開辟了新的區(qū)域。生物礁類型與古海洋邊界有一定聯(lián)系，通過對(duì)本區(qū)生物礁研究和與揚(yáng)子區(qū)生物礁及礁生物群落的對(duì)比，有助于從整體上把握二疊紀(jì)時(shí)古特提斯海域在我國(guó)范圍內(nèi)的總體格局。
8.鯨魚湖組（P2j）
為1∶25萬(wàn)鯨魚湖幅新建巖石地層單位。出露于鯨魚湖西北貝力克庫(kù)勒一帶，布喀達(dá)坂峰地區(qū)的哈夏-克里克-得亞及哈爾瓦以東地區(qū)。為淺海相碳酸鹽巖、碎屑巖夾少量火山巖。主要有黑色灰?guī)r、砂質(zhì)灰?guī)r、厚層塊狀灰?guī)r、微晶灰?guī)r、長(zhǎng)石巖屑砂巖、長(zhǎng)石石英細(xì)砂巖、千枚狀板巖、玄武巖、變蝕變球顆玄武巖等。未見底，厚度大于4353 m。
灰?guī)r中含冷水型單通道
類動(dòng)物群 Monodiexodina muztagensis M.rhaphidoformis，M.cf.wanneri，M.cf.caracorumensis，Parafusulina sp.，Darvasites ordinatus，Pseudofusulina cf.globosa等。上述 類化石稱Monodiexodina組合，與喀喇昆侖山口空喀山口地區(qū)中二疊世加溫達(dá)坂組 類組合面貌相近，西藏日土中二疊世吞龍共巴組有產(chǎn)出的記錄。另外，該組合中Darvasites ordinatus見于湖南邵東中二疊世棲霞組。鯨魚湖組的時(shí)代為中二疊世，相當(dāng)于我國(guó)南方棲霞階的中下部。 9.馬爾爭(zhēng)組（P2m）
出露于木孜塔格地區(qū)的黑龍山、兔子湖—鹿角溝一帶，阿爾喀山主脊一線，蘇魯皮提勒河南北兩岸，茶德爾塔格、羚羊?yàn)┮粠�；喀爾瓦以東及克其克孜蘇南、黑刺溝以北的黃山、都蘭托索河村一帶、黑海西南部大紅石溝一帶。巖石組合為玫瑰色、淺紅色厚層-塊狀灰?guī)r、泥-細(xì)晶灰?guī)r、淺色白云巖、硅化灰?guī)r、角礫狀灰?guī)r、糜棱灰?guī)r、中細(xì)粒巖屑長(zhǎng)石砂巖、巖屑長(zhǎng)石粉砂巖，夾泥鈣質(zhì)板巖、細(xì)礫巖等，局部地方火山巖比較發(fā)育，或有大量的碎屑巖出露。與下伏樹維門科組整合接觸，視厚度約6000 m�？傮w為開闊臺(tái)地、臺(tái)地邊緣相沉積，局部地方碎屑巖具復(fù)理石沉積特征，應(yīng)為次深海-深海相沉積。
阿拉克湖、冬給措納湖及庫(kù)賽湖、不凍泉地區(qū)，為構(gòu)造混雜巖，多呈巖片、巖塊產(chǎn)出，經(jīng)歷了不同程度的構(gòu)造置換和變形、變質(zhì)，在整體上近似無序，局部有序。復(fù)理石巖片是構(gòu)成本組混雜巖系的主體，為復(fù)理石沉積的粗粒長(zhǎng)石石英砂巖、中粗粒雜砂巖、不等粒巖屑砂巖、粉砂巖、粉砂質(zhì)板巖等，組成完整或不連續(xù)的鮑馬序列，發(fā)育大量的生物碎屑灰?guī)r塊。冀六祥等（1996）對(duì)長(zhǎng)石頭山、花石峽一帶的馬爾爭(zhēng)組復(fù)理石孢粉化石研究后認(rèn)為其組合為L(zhǎng)imatalasporites-Lundbladispora-Cycadospites-Veryhachium，顯示出中生代早期色彩。其中Lundbladispora為早三疊世的標(biāo)志分子，在國(guó)內(nèi)外下三疊統(tǒng)中廣泛分布，馬爾爭(zhēng)組部分復(fù)理石巖片時(shí)代應(yīng)屬早三疊世。可以認(rèn)為從中二疊世至早三疊世這一帶仍有殘留洋的存在。但從區(qū)域上看，本區(qū)并未發(fā)現(xiàn)從中二疊世至早三疊世呈連續(xù)沉積的剖面。
馬爾爭(zhēng)組在阿拉克湖以西地區(qū)，產(chǎn)
類化石，為Polydiexodina-Neoschwagerina組合，與之共生的有 Afphanella cf.schencki，Minojapanella sp.，Yangchienia compressa，Codono-fusiella sp.，Verbeekina sp.等，時(shí)代為中二疊世，相當(dāng)于我國(guó)華南茅口階的中下部，與青海祁連山南麓的巴音河群（P2B）、浙江桐廬丁家山組（P2d）頂部可以對(duì)比。馬爾組的時(shí)代以中二疊世為主。 10.再依勒克組（P1-2z）
為1∶25萬(wàn)于田縣幅新建巖石地層單位。出露于黃羊?yàn)┠衔髌綔�、阿克蘇河北及卡拉孔木達(dá)坂一帶。為海相灰?guī)r與陸相碎屑巖交互出現(xiàn)的沉積，巖性為生物灰?guī)r、微晶灰?guī)r、含礫灰?guī)r、砂巖、板巖等。與下伏哈拉米蘭河群平行不整合接觸，厚度大于2213 m。海相地層為淺海相碳酸鹽巖沉積，陸相地層以紫紅色為主，為炎熱氣候條件下的河流相及磨拉石建造。
產(chǎn)豐富的
類化石，下部以Misellina屬為主要分子，Eoparafusulina 屬次之。其中所產(chǎn)Misellina ovalis 是華南中二疊世棲霞期帶化石M.claudiae的重要組成分子，曾在藏東妥壩、芒康的蕎錯(cuò)組中發(fā)現(xiàn)，昆侖區(qū)阿爾格山的碧云山組中也有發(fā)現(xiàn)，層位相當(dāng)，均屬棲霞期的產(chǎn)物。Eoparafusulina屬出現(xiàn)于隆林期至棲霞期。該組下部的時(shí)代為早二疊世晚期至中二疊世早期。 上部產(chǎn)
類Neoschwagerina屬和Verbeekina屬，為主要分子，與華南Neoschwagerina Verbeekina帶相似，相當(dāng)于中二疊世茅口期的中期。 11.卡拉孔木組（P2k）
為1∶25萬(wàn)伯力克幅新建單位。主要出露于卡拉孔木達(dá)坂南、黃羊?yàn)┍�、硫磺達(dá)坂東一帶。下部為中薄層狀中粗粒長(zhǎng)石砂巖、脫�；Ｐ寄�?guī)r、放射蟲硅質(zhì)巖、硅質(zhì)鈣質(zhì)泥板巖；上部為薄層-葉片狀泥質(zhì)粉砂巖、粉砂質(zhì)板巖夾泥質(zhì)灰?guī)r。再依勒克一帶出現(xiàn)大量礫巖，并夾較多基性到酸性火山巖、火山碎屑巖，厚度不詳。
下部有放射蟲硅質(zhì)巖、英安巖和安山巖等，應(yīng)為活動(dòng)的較深水海相沉積；上部出現(xiàn)泥灰?guī)r、含礫灰?guī)r、砂礫巖，砂巖韻律清楚，具水下滑塌成因特點(diǎn)。
采到珊瑚化石Waagenophyllum indicum，時(shí)代屬中二疊世，整合于再依勒克組之上。屬中二疊世晚期。
12.卡拉勒塔什群（PK）
為1∶25萬(wàn)伯力克幅新建巖石地層單位。出露于伯力克地區(qū)。其定義為“緊鄰蘇巴什蛇綠混雜巖帶南側(cè)分布的一套島弧建造，以中酸性和中基性火山巖為主，夾火山碎屑巖，與上下地層均為斷層接觸，時(shí)代為二疊紀(jì)”。巖性組合下部為英安巖、石英安山巖及凝灰?guī)r、凝灰質(zhì)砂巖等；上部為安山巖、玄武安山巖及砂質(zhì)巖屑晶屑凝灰?guī)r、沉凝灰?guī)r等。為島弧火山巖建造，厚3698 m。
目前無確切的時(shí)代依據(jù)，前人曾劃歸寒武紀(jì)黑黑孜巖群�？紤]到該群為火山弧建造，且蘇巴什洋二疊紀(jì)初便開始俯沖消減，二疊紀(jì)末完全消亡，因此時(shí)代應(yīng)為二疊紀(jì)，并非寒武紀(jì)。
13.硫磺達(dá)坂砂巖（Pl）
為1∶25萬(wàn)于田縣幅新建巖石地層單位。出露于黃羊?yàn)┠弦粠�。其定義為“出露于蘇巴什蛇綠混雜巖帶的一套弧前復(fù)理石建造，巖性以長(zhǎng)石石英砂巖、粉砂質(zhì)板巖、泥質(zhì)硅質(zhì)巖為主夾有少量礫巖、含礫砂巖、灰?guī)r等。與大洋玄武巖關(guān)系密切，地層中韻律清楚，緊閉褶皺發(fā)育，變形極強(qiáng)，時(shí)代為二疊紀(jì)”。
該套地層以快速堆積的碎屑巖為主，其下部有含放射蟲硅質(zhì)巖，為較深水沉積，形成于俯沖帶海溝中。與下伏地層斷層接觸，厚度不詳。
下部硅質(zhì)巖中產(chǎn)放射蟲化石（但無化石名單），時(shí)代為二疊紀(jì)。
14.格曲組（P3g）
出露于阿拉克湖地區(qū)的亞門烏拉、烏蘭烏拉及核特馬爾爭(zhēng)及依克馬爾爭(zhēng)一帶，里海的西南部、哈拉山、它瓜馬日燈-花石峽一帶，興海地區(qū)醉馬灘一帶。阿拉克湖地區(qū)下部為石英質(zhì)礫巖、含礫砂巖、砂巖夾板巖及薄層灰?guī)r；為濱海相沉積，上部為灰紅、灰黑色塊狀生物礁灰?guī)r，為臺(tái)地相沉積。與下伏樹維門科組為不整合接觸，厚度大于167 m。興海地區(qū)，為紫紅色巨厚層復(fù)成分礫巖，長(zhǎng)石雜砂巖，厚度大于628 m，與下伏中二疊世中基性火山巖不整合接觸，屬特征的磨拉石建造。
下部產(chǎn)腕足類Oldhamina decipiens var.regularis，Uncinuellina timorensis，是晚二疊世的常見分子；上部礁灰?guī)r中產(chǎn)珊瑚Waagenophyllum indicum crassiseptatum，有孔蟲Calaniella sp.，其中珊瑚化石是我國(guó)南方晚二疊世的標(biāo)準(zhǔn)化石，有孔蟲則是長(zhǎng)興期的標(biāo)準(zhǔn)化石。格曲組的時(shí)代為晚二疊世長(zhǎng)興期。
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