清朝皇帝兼任蒙古可汗，中亞、新疆古文獻(xiàn)一般將清朝皇帝記錄為“博格達(dá)汗”。

1632年，皇太極率軍征討蒙古，成吉思汗嫡系子孫、蒙古末代可汗林丹戰(zhàn)敗逃往青海大草灘，兩年后患天花病死。林丹汗死后，其子額哲率眾向皇太極投降，并交出了當(dāng)年元順帝北逃時(shí)帶走的大元傳國玉璽。失去傳國玉璽，意味著延續(xù)了429年的蒙古帝國徹底滅亡。

1636年，以額哲為首的漠南蒙古十六部四十九位領(lǐng)主齊聚盛京，舉行庫里臺(tái)大會(huì)，以最正統(tǒng)的方式共尊皇太極為蒙古大汗，并奉上“博格達(dá)徹辰汗”的尊號(hào)，皇太極成為漠南蒙古共主、首位女真族蒙古可汗。從此以后，清朝歷代皇帝都身兼“蒙古大汗”。（漠南蒙古是繼承自黃金家族的最正統(tǒng)蒙古地域，而漠北蒙古是下層人士和奴隸部族所在的地方）

漠南蒙古歸順后金后，清朝歷代皇帝均對之采取和親政策，與漠南蒙古結(jié)為利益共同體。從此，困擾中原王朝上千年的長城以北邊患再未出現(xiàn)。