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微生物識別癌癥：里程碑式研究被指重大數(shù)據(jù)錯(cuò)誤，原作者不服
2023-08-07 14:44閱讀(121)
《科學(xué)》（Science）雜志的一篇文章引發(fā)爭議，該文章主要講述近期科學(xué)領(lǐng)域的一場激烈辯論，稱一項(xiàng)里程碑式的研究可能存在“重大錯(cuò)誤”，但被指存在錯(cuò)誤的科學(xué)家
《科學(xué)》（Science）雜志的一篇文章引發(fā)爭議，該文章主要講述近期科學(xué)領(lǐng)域的一場激烈辯論，稱一項(xiàng)里程碑式的研究可能存在“重大錯(cuò)誤”，但被指存在錯(cuò)誤的科學(xué)家表示不服。
當(dāng)?shù)貢r(shí)間2020年3月11日，《自然》（Nature）雜志刊登一篇名為《血液和組織的微生物組分析提示癌癥診斷方法》）的論文在當(dāng)?shù)貢r(shí)間2023年7月31日引起懷疑，美國加州大學(xué)圣地亞哥分校羅伯·奈特（Rob Knight）等科學(xué)家表明不同類型的癌癥與不同的微生物群落有關(guān)。他們使用人工智能梳理出可以提示特定癌癥的微生物DNA，并提出了“一類基于微生物組的新型癌癥診斷工具”。
就任于美國約翰霍普金斯大學(xué)的教授史蒂文· 薩爾茨伯格（Steven L. Salzberg）等人聲稱奈特等人2020年的論文存在“重大數(shù)據(jù)分析錯(cuò)誤”，也進(jìn)一步指出奈特等人未能正確地從測序的癌癥組織數(shù)據(jù)庫中過濾出人類DNA，這導(dǎo)致數(shù)以百萬計(jì)的人類基因序列被錯(cuò)誤地歸類為微生物。“這篇論文的主要結(jié)論是完全錯(cuò)誤的。
但是原作者奈特不認(rèn)可這些批評，奈特指出在2023年1月也曾有一些科學(xué)家對論文提出質(zhì)疑，但是實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)在2023年2月發(fā)表的預(yù)印本中作出官方回應(yīng)。但是旁觀的研究人員也提出這次薩爾茨伯格等人針對奈特團(tuán)隊(duì)2020年的論文提出了更多缺陷，而且論點(diǎn)充足，英國劍橋大學(xué)的專業(yè)細(xì)菌遺傳學(xué)家朱利安·帕克希爾（Julian Parkhill）表述：這是對原始論文錯(cuò)誤之處的精準(zhǔn)拆解。多位研究人員告訴《科學(xué)》雜志，微生物組科學(xué)具有研究生物醫(yī)學(xué)的前景，目前許多其他研究小組已經(jīng)將微生物與特定的癌癥聯(lián)系起來。此次辯論是有價(jià)值的，“這場辯論為嚴(yán)重依賴計(jì)算方法的微生物組研究提供了一個(gè)警示。人們對出版物的內(nèi)容缺乏質(zhì)疑，科學(xué)也需要有人做這類分析。”
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