按照地球生命進程來看，人類發(fā)現(xiàn)的最早的生物化石證明，地球生命起源于35億年前，17世紀，有一位學者寫下了著名的“生命配方”：把一件臟衣服放進容器，接著添加一些小麥，發(fā)酵21天，老鼠就會從中誕生。

然而最近，科學家在格陵蘭西部地區(qū)發(fā)現(xiàn)的證據(jù)顯示，生命可能早在大約38億年前就已在地球上存在。他們便是微生物生命。不可思議的是，它們在地球所遭遇的有史以來最猛烈的轟炸中，竟然能存活下來。而就是在這次轟炸中，一個像火星般大小的巨型巖石沖撞了地球，地球的外層因此氣化，碰撞產(chǎn)生的殘骸則聚合成了月球。這次碰撞的力度是如此之巨大，如果此前地球上存在過任何構(gòu)筑生命大廈的“磚頭”的話，這些“磚頭”都必定會在這次大碰撞中全軍覆滅。這就不由得讓人猜測：“生命大廈”的“奠基石”并不是在地球上鑄造的，而是來自于外太空。

需要經(jīng)歷10億年至20億年時間，原始微生物所產(chǎn)生的氧氣數(shù)量才足以改變整個地球大氣層。正是因為細菌們長期不懈的辛勤工作，才為我們所熟悉的多細胞生物——動植物以及這些動植物所賴以生存的環(huán)境的出現(xiàn)奠定了基礎(chǔ)。總而言之，微生物統(tǒng)治地球達30億年以上，也就是地球歷史的三分之二。

那么如此來推算的話，地球距今已經(jīng)有46億歲了；

上圖為草履蟲，最早的單細胞微生物生命距今38億年；

根據(jù)不同時期說法不同，暫且算多細胞生物距今可能有21億年；

最早的脊椎動物化石，距今5.1至5.2億年左右。就是上圖的樣子。

最早的爬行動物，距今大約3億年。

現(xiàn)代人類最早的化石，僅僅在距今大約8萬至12萬年前。

按著這個發(fā)現(xiàn)的時間比例來講，從猿猴進化成人是不可能的，那么所謂的進化，也僅僅是從原始人類進化成現(xiàn)代人類。

說到進化論最被大家詬病的地方，大概就是“進化”這個詞了。因為現(xiàn)代綜合進化論認為，生物是隨環(huán)境變化產(chǎn)生的生存壓力而不斷演化的。這個“演化”和“進化”相差甚遠。因為演化是沒有從低級到高級這一說的，只是環(huán)境變化決定了生物的發(fā)展方向，而突變的基因使生物基因庫（基因庫指的是這個物種所有基因的出現(xiàn)頻率）頻率發(fā)生變化，最終發(fā)生質(zhì)變的結(jié)果。比如說現(xiàn)在一些溶洞中發(fā)現(xiàn)的魚類和蝦類，因為不需要眼睛，所以紛紛退化了，身體也變得透明。這不是變低級了，而是依舊遵照演化規(guī)律。但可惜的是，進化這個詞被大家所熟悉，無法改變，所以就將錯就錯了。這跟大熊貓的叫法有些類似（按照分類，大熊貓應該是大貓熊）。當然，這些都不是事，最多容易誤導大家，覺得生物一直在有意識得進化一樣。

不過，說到漏洞，進化論當然也有，需要后人修修補補不斷完善，這很正常。任何理論都不是一次成型的，達爾文也只是發(fā)現(xiàn)了這個規(guī)律，但是在細節(jié)上有點讓現(xiàn)代的科學家頭疼。說幾個爭議比較大的給大家做一個參考吧。第一，按照達爾文進化論觀點，演化是一個漫長的過程，是不斷循序漸進發(fā)展出來的。所以，用它解釋寒武紀脊索動物成指數(shù)爆發(fā)出現(xiàn)有些困難。這就是達爾文當時沒有想到的。所以現(xiàn)代綜合進化論對這一點做出了修正，認為生物在突然獲得某種決定性轉(zhuǎn)變的時候，發(fā)展會出現(xiàn)跳躍式前進。比如當單細胞生物接納了線粒體（線粒體原本是原核生物，結(jié)果和其他細胞共生，變成了細胞的“能量工廠”）就是一個里程碑式的轉(zhuǎn)變。所以在物種演化上存在瓶頸效應，而這就是給達爾文進化論貼上的補丁。此外，為什么找不到中間過渡物種，也可以用這種效應解釋。不過，說實話，人類對一種東西的演化歷程的把握，已經(jīng)可以回答這個問題。那就是對于曾經(jīng)人類的頭號殺手，鼠疫的研究。近萬年的演化過程之清晰，讓人咋舌。

所以，漏洞這件事，就是科學家在努力研究的東西。一個完美的理論只配寫在教科書里，而科學家面對的永遠都是矛盾與困惑。

之前看過一個文章，最大的缺陷是地質(zhì)化石證據(jù)的缺失，比如雞鴨鵝都是從同一種鳥類演化來的，那么根據(jù)達爾文的理論，除了雞鴨鵝，中間進化的過程中還會有雞頭鴨身，鵝脖雞身，鴨頭鵝身等各種各樣的形態(tài)存在，最終雞鴨鵝被自然選擇存活到了今天。但是基因突變是隨機的，要產(chǎn)生雞鴨鵝這三種動物，可能需要產(chǎn)生數(shù)億個物種，打個比方，1到1000你隨意選擇3個數(shù)字，我來猜是哪三個，猜中的概率是十億分之一，那么除了猜中的那次，剩下的數(shù)字算是廢棄品，同樣，產(chǎn)生雞鴨鵝的過程需要無數(shù)的廢品，都被自然選擇在億萬年中淘汰掉了，那么如果你去挖，雞鴨鵝的化石一定是遠遠少于這些過渡物種的，可是事實是，我們從來沒有發(fā)現(xiàn)過這些過度物種的證據(jù)，這是這個理論最大的bug。達爾文的信徒以地質(zhì)勘探不足為理由搪塞，實際上我個人覺得完全是扯淡，當然雞鴨鵝只是比喻，今天能挖出猛犸象的化石，怎么就沒挖出一個物種向猛犸象演變的化石呢？按說進化過程中的廢品淘汰品數(shù)量級要遠超過最終成品呀！反正進化論我個人是不信的，只是現(xiàn)在學術(shù)界也沒有更靠譜的理論，大家只能選擇相信，哈哈

達爾文在1859年發(fā)表的“物種起源”一書中表達了生物進化論的主要理論“用進廢退、物競天擇、適者生存”，是對生命起源和發(fā)展的一種假說。這一理論是對當時流行的神學論主張的“人是上帝創(chuàng)造的”的批判。有趣的是，在1828年～1831年達爾文在英國劍橋大學攻讀神學，正是他的神學老師推薦他參加一次航海旅行，他在船上種植植物，發(fā)現(xiàn)了植物的趨光性，也就是向著陽光生長的奧秘，這使他對自然環(huán)境對生物的影響產(chǎn)生了濃厚的興趣。

生物進化論中一個重要的內(nèi)容是進化，也就是現(xiàn)有的物種是從別的物種進化來的，一個物種可以變成新的物種，也就是比如靈長類，人、猩猩、猴子都有一個共同的祖先，我們都是從某一個共同的物種進化來的。而這個共同的祖先已經(jīng)不存在，因為他們已經(jīng)進化成了人等其他物種。生物進化論的另一個內(nèi)容是進化的動力是自然選擇，是自然迫使物種不斷進化。

這個理論其實非常籠統(tǒng)和寬泛，如果非要說漏洞，一個漏洞是達爾文當時沒有把物種之間的相互影響，也就是物種的共生和寄生考慮進去，達爾文的進化論更多的是側(cè)重自然力迫使物種向某一方向進化，也就是進化是有方向性的，是自然環(huán)境確定了進化的方向。但有這樣一種可能，那就是進化是偶然或者突發(fā)事件導致的，是兩個或多個物種碰撞融合產(chǎn)生了新物種，不一定是有方向的，是突然發(fā)生的。

有科學證據(jù)表明某些物種進化的源動力來自于兩種以上物種的共生，比如人和病毒。達爾文想不到這一點很正常，因為在達爾文時代人們還不知道有病毒這么個物種，也不知道人類的胎盤形成是因為人類祖先感染了一個逆轉(zhuǎn)錄病毒造成的。我在以往的回答“病毒有沒有可能與生物構(gòu)成共生關(guān)系？”中有闡述，我們?nèi)祟惢�因中�?%都是病毒片段，如果在歷史上的某一個時間，我們的祖先沒有感染病毒，病毒沒有整合到人類的卵細胞中并一代一代遺傳下來，也就不會有人類的存在了。

研究發(fā)現(xiàn)這些病毒片段在黑猩猩和猴子身上也存在，但人類的內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒和大猩猩的更加接近，所以可能是不同的病毒感染了我們的祖先，整合到基因組的不同位置導致了進化的不同方向。所以進化不一定是有特定方向的，也不一定是一個物種定向的進化成某一新物種，而可能是一些突發(fā)事件，以及兩種以上物種的共生和融合產(chǎn)生了新的物種。

圖片展示了各種不同的內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒（ERV）是如何通過感染可能導致了靈長類的進化。

(https://www.helmholtz-muenchen.de/viro/research/retroviral-persistence-in-humans/human-endogenous-retroviruses/research-topics/index.html)

很高興回答你的問題。

首先，謝邀。

其實進化論是現(xiàn)在最科學和經(jīng)得起考究的一門學科了。在任何高校里，反對進化論的都很少�？脊拧⒐艢夂�?qū)W、基因?qū)W等層面的研究，都在一定程度上支撐著進化論。

那么進化論還存在什么樣的漏洞，或者bug呢？

仔細研究下進化論，就不難發(fā)現(xiàn)，這個問題的核心來自于：

進化的中間產(chǎn)物。

是的，鹿進化成長頸鹿的話，那么你見過半長不長的中間體的化石么？蟲子進化成魚，你見到了有報道發(fā)現(xiàn)有腮的蟲子的化石么？

所以，這種進化中間的副產(chǎn)品、或者說異類，如果數(shù)目過少，那么就很難在基因表達上占優(yōu)，也就不存在后面新的種族。但如果數(shù)目很多，就不應該在考古過程中，無法找到證明這個進化中間產(chǎn)物存在的證據(jù)！

如果覺得有用，您就給點個贊、粉個好友唄。

大約花費0.3KB的流量，哈哈哈哈哈。

畢竟，我辣么萌~

我可以斷言:這個問題下列舉的的“漏洞”，99%都不只是因為了解得還不夠多、不夠新。

目前進化論已經(jīng)是一個相當成熟的理論，而且看來近幾十年還沒有反例出現(xiàn)的可能。但是除了專業(yè)前沿的極少數(shù)研究者，大多數(shù)人對生物進化知識的了解都還停留在30-50年前的成果，而這些疑問的絕大多數(shù)都在這半個世紀中得到了解答。

比如有人疑問為何低等的細菌和高等動物同時存在于現(xiàn)代。這是因為生物進化是“適者生存”，而不是“高者生存”，低等也有低等的優(yōu)勢——比如體型小、能耗低、繁殖快。所以在高等生物鉆不進去、看不上、忍受不了的邊邊角角，仍然有低等生物生活的空間。

比如有人問人類進化的缺失環(huán)節(jié)。實際上它已經(jīng)在上世紀90年代在非洲發(fā)現(xiàn)了。而且不僅是化石，還包括通過DNA分析繪制了人類的進化樹、確定了我們智人與各種猿猴猿人和其他人類亞種分化的時間、確定了進化發(fā)生的地點與環(huán)境動力、甚至確定了人類文化的起源。建議可以去B站看看紀錄片《人類的旅程》或搜索“人類 進化”，其中有詳細解釋。

再比如質(zhì)疑恐龍為什么沒進化出智力的。近些年新發(fā)現(xiàn)的幾個事實是——其實我們哺乳類比恐龍出現(xiàn)得更早，進化的時間更長；有些種類的恐龍其實很聰明，智力已經(jīng)達到猿猴的水平；智慧進化的路上，我們的祖先靈長類并非唯一的候選人，甚至不是種子選手，只是在最后一關(guān)我們智人搶先了一步，把別人（包括且不限于海豚、虎鯨、章魚等，甚至包括我們的表兄弟尼安德特人等）擠下去了�！�—說白了就是我們走了狗屎運而已。

又比如眼睛的產(chǎn)生。這個疑問大約是60年前提出來的，目前已經(jīng)有完整的證據(jù)鏈了。包括生物的各個進化階段的眼睛——不完整，但都能用；包括不同類型眼睛的進化過程；包括這些進化過程的基因演化過程等。實際上眼睛的進化過程反而是目前進化論用來反駁神創(chuàng)論的經(jīng)典案例了。

還有一些回答里的其他疑問，實際上在生物學領(lǐng)域也都已經(jīng)有了解答。我這里就不一一解釋了，請感興趣的朋友善用百度。

這個問題也一直是我最關(guān)心的問題，我可以先簡單的回答一下。

這里的生物進化論應該特指達爾文的生物進化論。達爾文的生物進化論有一個核心:自然選擇。通俗的說就是達爾文認為所有物種都是從一個或幾個極少的原始生物演變而來的。

達爾文生物進化理論從誕生第一刻起，就是不完美的，在達爾文的《物種起源》里，達爾文自己也說到?jīng)]有搞清楚寒武紀生命大爆炸這一現(xiàn)象，并且當年達爾文把初稿送給當時著名的考古學家，古生物學家路易斯.阿加西斯，阿加西斯認為化石記錄尤其是寒武紀生物大爆炸的化石記錄是達爾文理論里無法逾越的難關(guān)。

達爾文的自然選擇產(chǎn)生新物種取決于三個不同因素:隨機產(chǎn)生的變異，變異的遺傳可能性，生存競爭。并且認為新物種的產(chǎn)生是一個漫長的積累過程。

現(xiàn)在所有的化石記錄均不能支持達爾文的觀點，沒有中間形態(tài)物種的化石�，F(xiàn)實中我們看到的新物種的產(chǎn)生都是一代產(chǎn)生的，植物里面的月見草，動物里面兩棲動物的孤雌生殖等現(xiàn)象都是一次突變產(chǎn)生新物種。

從分子生物學角度來看隨機產(chǎn)生的變異的話就更有意思啦，基因個別堿基產(chǎn)生的突變，大部分是無義突變和有害突變，并且突變一般產(chǎn)生的是新基因型，改變的只是基因的分布頻度，地理隔離無非造成的是基因的漂移，產(chǎn)生不了新基因，這樣的小變異產(chǎn)生不了新物種，只會豐富物種多樣性。

人和大猩猩的基因同源性在98%以上，但是是兩個物種，唯一的差異是人是23對染色體，而大猩猩是24對，微觀上看感覺是大猩猩和人的共同祖先的兩對染色體融合成一對染色體，即人的第二對染色體，導致人類的產(chǎn)生，但是像染色體級別的突變?nèi)�部是有害突變，就有些像遺傳物質(zhì)界發(fā)生了一次大的大陸板塊漂移一樣，這樣的發(fā)生概率本身非常的低，99.99%概率都是致死突變，如果歷史上真的是在自然的情況下發(fā)生的，就需要這樣的假設(shè)，第一，在同一個時間點，上下左右不超過20年吧，不然跨代太多啦，第二，同一個地點，不能超過100公里吧，古代有沒有電話什么高科技，第三，并且是男女同時發(fā)生了相同的位點融合;第四，媒婆還必須讓他們看上眼了并結(jié)合啦;第五，女方還必須要多子女或者，方圓百里同時產(chǎn)生了好多對這樣的突變才行，不然沒法產(chǎn)生下一代呀。

我假設(shè)說完了，大家什么感覺，這不像大自然的事件，倒像是實驗室的工作吧。

不知道有沒有提說過最簡機械理論，就是說一個有功能的機械裝置所需要的配件一個都不能少，少一個便不能工作，生命也是這樣由不同的機械裝置做成的，比如細菌的鞭毛，就是一個最簡單的搖動裝置，由如干個不同功能的蛋白組合在一起起到鞭毛擺動的功能，一旦缺少一個蛋白，鞭毛就無法工作，對于細菌來說就是有害突變，并且這幾個蛋白必須同時正確的產(chǎn)生，并且還是有目的性的。大自然有這么智慧嗎？有沒有感覺有點實驗室的味道呢？

表觀遺傳學的研究越來越熱，隨著研究的深入發(fā)現(xiàn)所謂表達蛋白的基因的作用越來越小，基因的調(diào)控越來越復雜，如果把遺傳物質(zhì)(基因)看成一個菜譜的話，我們發(fā)現(xiàn)我們還沒有找到廚師，到底是誰在決定什么時候做什么菜，什么時候上菜，菜做多少量，菜譜(基因)里面并沒有記載。

隨著表觀遺傳學學的深入研究，拉馬克的用進廢退的觀點也并非一無是處，環(huán)境或食物對人的影響是可以遺傳的，生命科學的研究越來越進入了玄學，但也越來越清晰啦。

我舉過智能機器人的例子來形容達爾文的進化論，可以參看我的微頭條。

不在多說了，達爾文的進化論現(xiàn)在來看漏洞百出，只能解釋一個物種的演化，解釋不了物種的產(chǎn)生，這也許就是達爾文進化論所面臨的現(xiàn)狀。

我說一下進化論的三個BUG。第一，一些歷史悠久的物種，比如獨霸地球數(shù)億年的恐龍為何沒有進化出智慧？相比之下人類的祖先才出現(xiàn)了幾百萬年。按所謂“進化”的原理，存在時間越長的物種越有資格進化。第二，既然猴子和人類的祖先同樣經(jīng)歷了嚴酷的自然環(huán)境演變過程，然而為何人類祖先最后演變成了人類，猴子還是猴子？他們各自經(jīng)歷過什么？第三，人類在數(shù)萬年前馴化了動物，比如豬牛羊貓狗雞鴨，畜牧業(yè)產(chǎn)生了，然后人類在飼養(yǎng)家禽家畜的過程中，發(fā)現(xiàn)動物有自救本能，比如家豬被毒蛇咬了，中毒之后，家豬會主動跑到森林中大量進食某種植物，然后睡一覺就解毒了，這個現(xiàn)象被原始人發(fā)現(xiàn)并模仿，最終誕生了中醫(yī)草藥學。請問，用進化論如何解釋動物自救本能？第一個發(fā)現(xiàn)這種植物能夠解毒的動物祖先是如何發(fā)現(xiàn)這種植物的？然后動物祖先是如何將這些信息傳遞給下一代的？對于本能的理解，也有助于解釋人類的初生嬰兒是如何學會吃奶的？

進化論的漏洞非常多！

首先，就是它違反了熱力學第二定律，即可以使熵減小。但是，我們看到的事實是，熵都是增加的。比如你燃燒煤炭、木頭以后，只能形成灰燼和霧霾。而灰燼和霧霾顯然是比煤炭和木頭更無序的東西！那么按照達爾文的進化論，各種物種在進化的過程中，就是依靠變異不斷的將優(yōu)秀的基因保留下來，最終形成更優(yōu)秀的物種。比如從古猿到人，就是這樣。但是，實際上在現(xiàn)實生活中，上一代到下一代越來越優(yōu)秀的例子反而并不多。比如，中國古代各個朝代，開國之君都是經(jīng)過嚴格淘汰后的優(yōu)勝者，因此一定都很優(yōu)秀。而其繼任者雖然也有優(yōu)秀的，但是數(shù)量就大幅度下降，代代相傳，后世雖然有明君，但是相對于由一個開國皇帝，變成成百上千的后代以后才產(chǎn)生一個明君，實際上恰恰說明皇帝家族即使優(yōu)選配偶以后也沒有實現(xiàn)所謂的進化，反而是在退化。最終甚至在明朝和清朝后期都出現(xiàn)君王不孕不育的狀況。

其次，就是無數(shù)的觀察實例也是進化論不能解釋的。比如為什么古猿在環(huán)境變化之后，就能逐步進化成人類。但是蟑螂和銀杏等物種就可以歷經(jīng)幾億年卻不進化？再比如為什么寒武紀物種會大爆發(fā)，如果進化論成立，它們?yōu)槭裁淳涂梢杂媚敲炊痰臅r間進化？所以，一遇到別人質(zhì)疑，左手拿著環(huán)境變化，右手拿著變異，進行詭辯，實在是有違科學精神��！

從小就學進化論，曾經(jīng)對達爾文的這套理論深信不疑。后來知道遺傳基因了，覺得進化論確實有所遺漏。人類和黑猩猩的基因很相似，于是有人猜測這是“進化”的結(jié)果。不過進化干嘛力量變小了，身上的毛也進化掉了？身上有毛可以抵御寒冷啊。人類的視力、嗅覺、聽覺都不咋樣，不是說物競天擇、適者生存嗎？還有，人生孩子很吃力，怎么可以這樣進化呢？還有，熊會冬眠，這種過冬方式挺不錯的，如果有人說這是進化的結(jié)果誰信�。慷�天到了，老虎獅子老鼠狐貍和人一起冬眠，不會冬眠的物種都滅絕，那才叫進化論。還有海龜生蛋，這都是什么落后的繁殖方式，早就該進化了。大象的長鼻子你非要說是進化出來的，我只有呵呵了，看看章魚的觸手那才叫進化，有你進化鼻子的功夫咱進化幾條觸手不好嗎？