宮頸囊腫絕大多數(shù)情況下是子宮頸的生理性變化，子宮頸轉(zhuǎn)化區(qū)內(nèi)鱗狀上皮取代柱狀上皮過程中，新生的鱗狀上皮覆蓋子宮頸腺管口或伸入腺管，將腺管口阻塞，導(dǎo)致腺體分泌物引流受阻，潴留形成囊腫。當然，也有少數(shù)是宮頸部位受到病原體感染后，局部發(fā)生炎癥性反應(yīng)和變化，使得宮頸腺體內(nèi)分泌物阻塞在宮頸腺管處無法外排，進而導(dǎo)致局部囊性腫物形成。