肛門膿腫的治療方式有手術(shù)治療和非手術(shù)治療，較小的肛門膿腫，可采用非手術(shù)治療，包括局部涂抹抗生素藥膏，溫水坐浴以及局部物理治療等。較大的肛門膿腫需要手術(shù)切除治療。非手術(shù)治療不能治愈肛門膿腫，手術(shù)治療可起到根治的效果。