（1）大多數(shù)先天性肝囊腫是在無意中發(fā)現(xiàn)的，肝囊腫都是不生長的或者生長很緩慢的；一般而言，囊腫較小且無癥狀的病人，一般無需特殊處理，一般情況下醫(yī)生都不建議切除，定期B超檢查觀察，定期隨訪即可。

（2）囊腫較大癥狀明顯或不能耐受者，或已影響肝臟功能，則可實(shí)施手術(shù)治療，主要行囊腫“開窗術(shù)”或“去頂術(shù)”治療，多在腹腔鏡下完成該手術(shù)；對于并發(fā)感染、囊內(nèi)出血，可在“開窗術(shù)”后置管引流，待引流液清亮、正常后拔除引流管；對囊液有膽汁者，應(yīng)尋找膽管漏口予以縫合、置管；若病情局限在肝一葉且病情必要時(shí)，或開窗術(shù)效果不佳者，可考慮做肝葉切除。

（3）多發(fā)性肝囊腫一般僅限于處理其中可能引起癥狀的大囊腫，可行囊腫“開窗術(shù)”緩解癥狀；廣泛的多發(fā)性肝囊腫可做肝移植。

（4）年老體弱或重要器官功能不全者不宜手術(shù)。