根據(jù)你的問(wèn)題“房地產(chǎn)企業(yè)破產(chǎn)稅收有哪些？”及你提供的資料“房地產(chǎn)企業(yè)在建工程資產(chǎn)被法院評(píng)估價(jià)值3.9億最后以2.1億變賣(mài)該資產(chǎn)，現(xiàn)在企業(yè)破產(chǎn)清算，企業(yè)對(duì)外債務(wù)4億，稅務(wù)也開(kāi)出3千萬(wàn)的增值稅、土地增值稅以及企業(yè)所得稅優(yōu)先支付的通知。不知道這些稅款該不該交以及可以申請(qǐng)減免不�！焙投悇�(wù)局給你單位提供的補(bǔ)稅資料可以得出：

一、房地產(chǎn)企業(yè)破產(chǎn)涉稅處理
（一）增值稅、城市維護(hù)建設(shè)稅、教育費(fèi)附加及地方教育費(fèi)附加涉稅處理

1、如果法院的裁定預(yù)售房屋購(gòu)買(mǎi)者與破產(chǎn)企業(yè)簽訂的預(yù)售房合同全部解除，則破產(chǎn)企業(yè)不存在納稅義務(wù)，原來(lái)已經(jīng)申報(bào)按3%的征收率預(yù)繳的增值稅及對(duì)應(yīng)的城市維護(hù)建設(shè)稅、教育費(fèi)附加和地方教育費(fèi)附加和預(yù)征的土地增值稅應(yīng)該給予退稅，沒(méi)有繳納的不用補(bǔ)繳。一般這種破產(chǎn)清算沒(méi)有交工的房屋法院都會(huì)裁定預(yù)售房屋購(gòu)買(mǎi)者與破產(chǎn)企業(yè)簽訂的預(yù)售房合同全部解除，然后重新與購(gòu)買(mǎi)破產(chǎn)企業(yè)的新的房地產(chǎn)公司重新簽訂購(gòu)房合同；

2、拍賣(mài)的資產(chǎn)應(yīng)按拍賣(mài)的費(fèi)用計(jì)算繳納增值稅及對(duì)應(yīng)的城市維護(hù)建設(shè)稅、教育費(fèi)附加和地方教育費(fèi)附加，稅務(wù)局提供的補(bǔ)稅資料中這四個(gè)稅種稅額是應(yīng)該補(bǔ)繳的；

3、破產(chǎn)房地產(chǎn)企業(yè)不用按稅務(wù)局提供的資料5%預(yù)征率預(yù)繳土地增值稅，可以進(jìn)行破產(chǎn)清算計(jì)算土地增值稅，按清算結(jié)果補(bǔ)繳土地增值稅；

4、破產(chǎn)房地產(chǎn)企業(yè)也不用按3%的預(yù)征率預(yù)繳企業(yè)所得稅，可以按破產(chǎn)清算計(jì)算企業(yè)所得稅應(yīng)納稅所得額，補(bǔ)繳企業(yè)所得稅；

企業(yè)破產(chǎn)，要進(jìn)行企業(yè)清算，需要處理企業(yè)財(cái)產(chǎn)，處置資產(chǎn)、追索債權(quán)、清償債務(wù)、然后對(duì)剩余財(cái)產(chǎn)按照股東出資比例分配，最后辦理注銷(xiāo)手續(xù)。

一般情形，企業(yè)走到破產(chǎn)邊緣基本是資不抵債，陷入困境，因此破產(chǎn)的企業(yè)涉及到的稅收可能有欠稅和財(cái)產(chǎn)清理中產(chǎn)生的涉稅事項(xiàng)。

欠稅：破產(chǎn)申請(qǐng)受理之日超過(guò)納稅期限的稅款為欠稅，欠稅在企業(yè)破產(chǎn)中屬優(yōu)先債權(quán)類(lèi)。

財(cái)產(chǎn)清理變賣(mài)產(chǎn)生的稅款：不動(dòng)產(chǎn)的處理不管是轉(zhuǎn)讓還是做為剩余資產(chǎn)分配給股東，都會(huì)發(fā)生產(chǎn)權(quán)上的轉(zhuǎn)移，涉及到增值稅、附加稅費(fèi)、印花稅、土地增值稅、企業(yè)所得稅。

破產(chǎn)清算中處理財(cái)產(chǎn)涉及的稅收屬于破產(chǎn)費(fèi)用類(lèi)，進(jìn)入破產(chǎn)程序后 因履行合同和發(fā)生經(jīng)營(yíng)而產(chǎn)生的稅收歸為共益?zhèn)鶆?wù)類(lèi)。

政策依據(jù)：《企業(yè)破產(chǎn)法》第四十一條、第四十二條、第四十三條及《最高人民法院關(guān)于審理企業(yè)破產(chǎn)案件若干問(wèn)題的規(guī)定》（法釋〔2002〕23號(hào)）

破產(chǎn)費(fèi)用和共益?zhèn)鶆?wù)是優(yōu)先清償?shù)�，也就是說(shuō)財(cái)產(chǎn)變賣(mài)了，要優(yōu)先清償破產(chǎn)費(fèi)用和公益?zhèn)鶆?wù)，然后才是按順序清償破產(chǎn)債權(quán)。

關(guān)于題主的問(wèn)題：根據(jù)題主給出的資料和數(shù)據(jù)，稅務(wù)機(jī)關(guān)列出的稅收都是進(jìn)入破產(chǎn)申請(qǐng)后處置不動(dòng)產(chǎn)產(chǎn)生的稅收：在建工程變賣(mài)2.1億元是含稅金額，增值稅、土地增值稅、企業(yè)所得稅都是以變賣(mài)收入為計(jì)稅依據(jù)計(jì)算的。

增值稅按簡(jiǎn)易計(jì)稅計(jì)算的，土地增值稅、企業(yè)所得稅是按核定征收率計(jì)算的。

因此，表中所列的稅收為破產(chǎn)費(fèi)用類(lèi)，當(dāng)然破產(chǎn)費(fèi)用還有其他項(xiàng)目，破產(chǎn)費(fèi)用類(lèi)的稅收應(yīng)當(dāng)以財(cái)產(chǎn)處理所得隨時(shí)清償?shù)�，沒(méi)有稅收優(yōu)惠，用變賣(mài)的2.1億元償還。

如果財(cái)產(chǎn)處理不足以清償破產(chǎn)費(fèi)用和共益?zhèn)鶆?wù)時(shí)，首先清償破產(chǎn)費(fèi)用，若破產(chǎn)財(cái)產(chǎn)不足以清償破產(chǎn)費(fèi)用，企業(yè)可申請(qǐng)終止破產(chǎn)程序，法院可依管理人申請(qǐng)而裁定終止破產(chǎn)程序，然后企業(yè)憑法院裁定辦理企業(yè)注銷(xiāo)，稅務(wù)機(jī)關(guān)在破產(chǎn)企業(yè)注銷(xiāo)登記后，根據(jù)相關(guān)的政策規(guī)定核銷(xiāo)這部分稅款。

特殊情形：在破產(chǎn)程序中，如果企業(yè)實(shí)施了破產(chǎn)重組，可不用繳納增值稅，企業(yè)所得稅符合條件可以特殊性處理。

企業(yè)破產(chǎn)，是一件比較悲催的事情，企業(yè)職工以及企業(yè)的老板股東，都是比較肉疼的事情。按照《中華人民共和國(guó)企業(yè)破產(chǎn)法》的規(guī)定，破產(chǎn)清算，有一整套的法律規(guī)定，上面比較清楚的規(guī)范了破產(chǎn)過(guò)程中，企業(yè)用剩余資產(chǎn)余額，支付相關(guān)費(fèi)、稅的支出順序。就一般情況而言，其支出順序是有先后的：

1、第一順序，企業(yè)人員工資，資產(chǎn)不足支付的，一般首選按照當(dāng)?shù)卣�府�?guī)定的最低生活保障或者最低工資支付，超過(guò)的，按照比例計(jì)算支付。

2、國(guó)家規(guī)定的稅收，一般是沒(méi)有強(qiáng)制先交什么稅，主要是按照交易習(xí)慣和交易區(qū)間的規(guī)定，在什么時(shí)候就交什么稅。企業(yè)一般做法，是按照先交車(chē)船稅等財(cái)產(chǎn)稅，再交增值稅，再交流轉(zhuǎn)稅，再交土地增值稅，再交所得稅。交完為止。

3、應(yīng)付賬款，一般按照比例分配，大家雨露均沾。

4、 股東分配，一般也是按照股東投資金額，按照剩余財(cái)產(chǎn)，按照比例分配。